Filters

–
Putative Effectors
Secretion:  signal - localization
Homology
Functional
Structure
Biophysics
–
–
–
–
–
–
Composition
Expression
DGE
Change direction refers to the second condition in the label, e.g., positive log2FC for X vs Y → Y up-regulated.
CURRENT STATS:
subset: 18,135 proteins
SCN effectors: 1,221 (putative)
secreted: 2,729    (mean SignalP6: 0.16)
protein length: 422.8 (mean), 7 (min), 5,730 (max)
Core Genomics Effectors Secretion Homology Functional Sequence Structure Biophysics Composition Expression DGE
Ala Asn Asp Cys Glu Gln Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Arg Ser Thr Val Trp Tyr Xaa
0.45
1.18
1.63
0.94
0.65
0.80
0.56
1.56
1.30
1.26
1.24
2.29
1.62
1.20
1.11
1.00
0.89
0.65
1.80
0.23
0.00
0.44
2.52
0.35
0.77
1.43
1.31
0.23
0.80
1.91
1.42
1.93
1.69
2.21
0.43
0.46
0.77
0.52
0.63
0.49
1.03
0.00
0.72
1.88
1.21
0.98
0.95
0.85
0.40
1.43
1.38
1.48
1.08
1.40
1.32
1.19
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0.88
0.86
0.72
1.47
0.42
0.00
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1.04
1.14
1.09
1.03
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1.04
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1.02
1.00
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0.00
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1.20
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0.93
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1.21
2.00
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0.97
0.47
1.70
1.12
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0.00
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1.11
1.73
1.81
0.97
0.98
1.62
0.86
0.97
1.07
0.78
0.51
1.71
0.49
0.00
1.21
2.24
1.35
1.28
0.99
1.52
1.24
1.11
0.99
0.80
0.45
2.18
1.03
0.28
0.91
0.74
0.73
1.01
0.00
0.44
0.00
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1.45
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1.07
1.26
1.45
1.18
1.06
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1.89
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0.00
0.36
1.90
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1.42
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0.77
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0.00
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1.38
0.90
1.37
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1.52
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2.97
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1.52
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1.73
0.00
0.00
1.80
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1.45
0.00
0.00
0.00
0.00
0.58
1.26
1.22
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0.49
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0.70
1.67
1.67
1.70
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2.00
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2.58
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1.90
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0.78
0.99
0.95
0.00
0.63
2.20
0.98
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2.03
1.80
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1.59
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0.00
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0.81
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1.26
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1.20
1.23
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0.00
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1.17
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1.47
1.51
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1.66
1.43
1.42
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1.74
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0.00
1.01
1.21
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2.10
1.43
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2.09
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1.24
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1.02
1.19
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0.00
0.47
1.31
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0.00
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1.00
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2.04
1.17
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1.50
1.33
0.00
1.08
1.70
1.65
1.25
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1.21
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0.00
0.60
1.25
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1.25
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1.10
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0.00
0.86
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1.38
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1.46
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1.27
1.03
0.93
2.92
0.95
0.51
1.25
0.87
0.56
1.39
2.06
0.90
0.00
0.61
1.70
0.91
0.69
0.59
0.58
0.51
1.63
1.45
1.39
1.18
0.74
1.88
1.16
1.33
0.65
0.99
0.99
1.55
0.81
0.00