Filters

–
Putative Effectors
Secretion:  signal - localization
Homology
Functional
Structure
Biophysics
–
–
–
–
–
–
Composition
Expression
DGE
Change direction refers to the second condition in the label, e.g., positive log2FC for X vs Y → Y up-regulated.
CURRENT STATS:
subset: 18,135 proteins
SCN effectors: 1,221 (putative)
secreted: 2,729    (mean SignalP6: 0.16)
protein length: 422.8 (mean), 7 (min), 5,730 (max)
Core Genomics Effectors Secretion Homology Functional Sequence Structure Biophysics Composition Expression DGE
Ala Asn Asp Cys Glu Gln Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Arg Ser Thr Val Trp Tyr Xaa
0.67
1.64
0.78
1.30
0.92
0.90
0.45
1.38
1.79
1.15
0.80
2.07
2.09
0.77
1.28
0.90
0.95
0.69
2.51
0.15
0.00
0.73
1.83
0.49
0.22
1.18
1.77
0.28
1.18
1.15
0.96
1.43
1.85
1.40
0.73
1.25
1.42
1.08
0.60
0.24
0.97
0.00
0.57
1.40
1.62
0.59
0.96
0.88
0.62
1.15
1.34
1.48
0.91
0.68
1.36
1.33
1.17
0.86
0.80
0.65
1.99
0.68
0.00
0.87
1.49
0.78
0.98
1.13
0.91
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1.60
1.34
1.30
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1.48
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0.80
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1.80
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1.13
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1.66
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0.00
0.47
1.78
1.00
0.74
0.80
0.92
0.54
1.55
2.02
1.32
0.80
0.84
1.79
0.92
1.02
0.61
1.14
0.80
2.21
0.98
0.00
0.52
1.76
1.07
0.58
0.98
0.79
0.60
1.69
1.69
1.44
0.77
0.83
1.48
1.13
0.97
0.76
0.97
0.72
2.16
0.99
0.00
0.68
0.00
0.43
0.00
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1.76
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1.11
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1.41
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1.20
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1.04
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1.23
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1.80
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1.18
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1.27
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0.00
0.68
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0.68
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2.12
2.12
1.14
1.12
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1.20
0.00
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1.29
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0.00
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1.11
1.21
1.28
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0.00
0.60
1.89
1.41
0.89
1.11
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1.29
1.15
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1.06
1.30
1.54
1.06
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0.00
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1.33
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1.16
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0.64
1.06
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2.60
0.66
0.00
0.77
1.00
0.78
0.70
0.80
1.75
0.81
1.27
1.24
1.09
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1.34
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1.17
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0.00
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1.55
1.50
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1.12
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0.00
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1.17
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1.10
1.27
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2.32
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1.26
1.34
2.07
1.15
0.53
0.00
0.39
0.00
0.66
1.73
1.20
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1.00
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1.71
1.71
1.54
0.74
1.01
1.27
1.15
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0.00
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2.04
1.96
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1.25
1.09
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1.07
1.07
0.00
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0.00
2.39
2.08
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1.28
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1.40
0.00
0.00
0.00
0.47
1.11
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1.64
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0.00
0.00
0.00
1.25
1.07
1.12
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0.92
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0.00
1.04
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1.69
1.08
1.53
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1.73
1.30
1.30
1.05
0.99
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0.00
0.60
1.20
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1.00
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2.00
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0.00
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1.25
1.64
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1.32
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1.54
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1.19
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1.63
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0.47
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1.47
1.60
0.72
1.71
2.05
0.96
1.02
1.24
0.73
0.64
2.44
0.39
0.00
0.56
1.78
1.13
0.29
0.99
0.58
0.64
1.27
1.39
1.46
0.86
1.17
1.57
1.25
1.21
0.81
0.97
0.64
2.40
0.75
0.00