Filters

–
Putative Effectors
Secretion:  signal - localization
Homology
Functional
Structure
Biophysics
–
–
–
–
–
–
Composition
Expression
DGE
Change direction refers to the second condition in the label, e.g., positive log2FC for X vs Y → Y up-regulated.
CURRENT STATS:
subset: 18,135 proteins
SCN effectors: 1,221 (putative)
secreted: 2,729    (mean SignalP6: 0.16)
protein length: 422.8 (mean), 7 (min), 5,730 (max)
Core Genomics Effectors Secretion Homology Functional Sequence Structure Biophysics Composition Expression DGE
Ala Asn Asp Cys Glu Gln Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Arg Ser Thr Val Trp Tyr Xaa
1.79
0.81
0.67
0.86
0.55
0.94
0.80
1.06
0.90
1.77
0.23
1.13
1.28
1.07
0.94
1.29
0.88
0.85
0.89
0.74
0.00
1.22
1.33
0.49
1.86
1.05
0.54
0.68
1.80
0.80
1.22
1.23
2.12
1.17
0.98
0.92
0.81
1.08
0.68
2.08
0.09
0.00
0.75
2.26
0.66
0.70
0.74
0.83
0.87
1.22
1.44
1.04
0.86
1.43
1.12
0.93
1.32
0.81
0.93
0.80
1.87
1.19
0.00
0.84
1.40
1.18
1.33
1.22
0.95
0.71
1.20
1.18
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1.38
1.13
1.05
1.10
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0.78
0.70
0.71
1.02
0.00
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2.34
0.86
0.31
1.08
1.29
1.02
1.18
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1.28
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0.84
0.84
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0.72
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0.00
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0.94
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1.50
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0.95
0.71
0.98
1.48
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1.19
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0.81
1.28
1.08
0.00
0.85
1.53
1.19
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1.87
0.52
1.46
1.14
1.68
0.33
3.01
1.62
0.56
0.89
0.73
0.72
0.77
1.12
1.29
0.00
0.65
2.29
0.68
0.55
1.20
0.95
1.08
0.67
1.60
1.29
0.89
1.25
1.11
0.61
0.81
1.22
0.79
0.72
0.82
0.86
0.00
1.50
2.46
0.86
4.46
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0.00
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0.00
0.35
0.00
1.01
2.56
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1.63
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1.97
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1.60
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3.24
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0.45
0.64
0.45
0.65
0.36
0.00
0.69
0.00
0.79
1.25
1.24
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1.50
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1.14
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2.52
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0.00
0.89
0.89
0.96
0.66
0.64
0.99
0.63
2.16
1.50
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0.98
0.89
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0.00
1.08
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1.17
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1.00
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0.00
0.00
0.00
1.28
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1.17
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1.27
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0.00
1.12
0.00
1.20
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1.11
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1.40
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1.60
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0.33
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0.09
0.00
4.20
1.45
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0.00
0.77
1.47
1.44
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1.45
1.05
1.32
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1.32
1.08
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0.00
0.91
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0.98
1.08
1.18
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1.16
1.00
0.22
0.00
0.52
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1.01
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1.06
2.00
1.33
1.00
1.40
1.84
1.12
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1.18
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0.00
0.92
0.25
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1.85
1.63
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1.85
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1.57
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0.00
0.00
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0.00
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0.00
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1.00
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1.20
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1.33
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1.41
1.38
1.68
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1.03
1.01
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1.10
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1.99
2.28
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1.58
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1.02
1.11
0.85
0.00
1.07
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1.41
0.58
1.74
1.41
1.05
0.83
1.44
1.47
0.94
1.29
0.70
1.04
0.80
2.04
1.26
0.00
0.89
1.41
1.06
0.70
0.82
1.84
0.37
1.46
1.20
1.82
0.44
1.32
1.56
0.65
1.14
1.54
0.70
0.71
0.52
0.40
0.00