Filters

–
Putative Effectors
Secretion:  signal - localization
Homology
Functional
Structure
Biophysics
–
–
–
–
–
–
Composition
Expression
DGE
Change direction refers to the second condition in the label, e.g., positive log2FC for X vs Y → Y up-regulated.
CURRENT STATS:
subset: 18,135 proteins
SCN effectors: 1,221 (putative)
secreted: 2,729    (mean SignalP6: 0.16)
protein length: 422.8 (mean), 7 (min), 5,730 (max)
Core Genomics Effectors Secretion Homology Functional Sequence Structure Biophysics Composition Expression DGE
Ala Asn Asp Cys Glu Gln Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Arg Ser Thr Val Trp Tyr Xaa
0.58
1.02
0.46
1.29
0.31
1.28
0.89
1.88
1.11
0.76
1.33
1.10
2.08
0.72
2.17
1.34
0.61
1.23
0.00
0.55
0.00
0.90
1.07
1.28
0.85
1.24
0.63
0.51
1.59
1.02
1.10
0.80
1.46
1.67
0.68
1.73
0.71
1.10
1.07
0.54
0.83
0.00
0.77
1.57
1.01
0.18
0.73
1.42
0.55
1.98
1.12
1.14
0.24
1.17
1.54
1.47
1.38
1.70
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1.00
0.51
0.19
0.00
0.76
0.76
0.77
1.29
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1.46
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0.00
0.80
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1.06
1.10
2.04
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1.35
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0.00
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1.00
1.57
1.02
1.03
2.03
1.26
0.77
1.30
0.61
0.96
1.13
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0.98
0.00
1.08
1.34
0.82
0.87
0.96
1.35
0.51
1.63
1.45
1.26
0.53
1.03
1.05
1.06
1.08
1.11
1.11
0.69
1.55
0.74
0.00
0.84
1.02
0.91
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0.55
0.00
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1.70
1.30
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2.12
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1.99
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1.30
1.21
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1.50
0.00
0.82
1.65
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2.19
1.17
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2.06
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1.06
1.04
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0.00
1.12
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1.13
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0.00
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1.70
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1.11
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0.65
0.50
0.00
0.81
0.89
0.83
0.50
0.97
0.89
0.83
1.73
1.14
1.33
0.83
1.40
1.57
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1.45
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1.02
1.40
1.02
0.00
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1.00
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1.03
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1.08
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1.21
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1.98
1.34
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1.20
0.92
0.70
1.02
1.35
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0.00
1.03
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0.75
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1.48
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1.21
1.71
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0.00
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1.50
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1.14
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2.02
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1.01
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0.00
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1.15
1.56
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0.00
0.55
1.21
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2.11
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1.17
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0.90
2.62
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1.84
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0.90
1.34
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0.00
1.46
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2.30
1.25
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1.08
1.15
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0.61
0.00
0.85
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1.22
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1.46
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1.50
0.00
0.63
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1.43
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1.11
1.17
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1.13
1.36
1.35
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0.00
0.65
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1.28
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1.54
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1.30
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0.00
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1.27
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1.06
1.05
1.05
0.00
0.76
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1.30
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1.14
1.22
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1.07
1.32
1.06
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1.48
1.07
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0.60
0.66
0.00
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1.38
1.12
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1.16
1.12
1.72
1.54
1.58
0.84
0.71
0.81
1.36
0.53
1.01
0.64
0.00
0.77
1.19
0.91
0.69
1.42
1.05
0.80
1.25
1.16
1.29
0.88
1.57
1.45
0.82
1.65
0.76
0.86
0.87
0.46
0.53
0.00