Filters

–
Putative Effectors
Secretion:  signal - localization
Homology
Functional
Structure
Biophysics
–
–
–
–
–
–
Composition
Expression
DGE
Change direction refers to the second condition in the label, e.g., positive log2FC for X vs Y → Y up-regulated.
CURRENT STATS:
subset: 18,135 proteins
SCN effectors: 1,221 (putative)
secreted: 2,729    (mean SignalP6: 0.16)
protein length: 422.8 (mean), 7 (min), 5,730 (max)
Core Genomics Effectors Secretion Homology Functional Sequence Structure Biophysics Composition Expression DGE
Ala Asn Asp Cys Glu Gln Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Arg Ser Thr Val Trp Tyr Xaa
0.66
1.14
1.11
0.14
1.09
1.47
0.68
1.02
1.54
1.43
1.11
0.24
2.04
0.63
0.75
1.40
0.80
0.87
0.94
0.48
0.00
0.52
1.21
1.89
0.00
1.85
0.76
0.79
2.96
1.48
0.80
1.01
1.74
1.44
0.85
0.30
0.74
0.61
1.12
1.14
0.65
0.00
0.65
1.19
1.02
0.18
1.28
4.32
0.85
3.57
1.13
1.03
0.85
1.20
1.56
1.37
0.21
0.51
0.42
0.31
0.00
0.60
0.00
0.76
1.73
0.68
0.32
1.12
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1.40
1.32
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1.50
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0.00
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0.53
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0.36
1.19
0.83
1.33
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1.11
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0.88
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0.65
0.00
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1.20
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0.45
0.70
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1.15
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0.00
0.18
0.00
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0.48
1.59
1.71
0.58
0.98
1.79
0.87
1.36
1.29
0.74
0.87
1.65
0.77
0.00
0.91
0.91
1.26
1.04
1.73
0.22
0.67
0.43
1.15
1.35
1.18
0.76
1.68
0.67
1.85
1.18
0.57
0.79
0.33
0.13
0.00
1.02
0.58
1.25
1.08
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1.25
1.44
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0.00
0.18
0.00
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0.34
0.32
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1.05
1.18
1.14
2.16
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1.19
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0.00
1.71
0.00
1.03
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0.89
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0.00
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1.50
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1.44
1.08
1.45
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0.80
0.83
1.04
0.00
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1.11
1.42
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1.86
1.48
0.41
0.87
1.22
0.86
1.40
1.36
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1.84
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1.68
0.00
0.74
1.01
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1.94
1.37
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1.14
0.00
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1.31
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1.00
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0.00
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0.54
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1.41
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1.37
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1.34
1.19
1.50
1.14
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0.00
1.09
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1.20
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1.34
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1.21
0.80
1.43
0.00
0.89
0.80
1.29
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0.88
1.19
1.43
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0.00
1.00
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0.00
1.38
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1.03
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1.10
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1.78
2.16
0.80
1.52
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0.00
0.90
2.62
1.28
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0.00
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1.10
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1.88
1.44
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2.35
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1.45
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1.41
0.00
0.85
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4.34
1.02
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0.47
1.16
2.04
2.47
0.35
0.08
2.44
0.39
0.62
0.48
0.65
0.06
0.00
0.63
1.09
0.61
0.84
0.81
0.77
0.40
1.13
1.17
1.47
0.88
0.89
1.30
0.76
1.04
0.81
3.21
0.57
1.45
0.72
0.00