Filters

–
Putative Effectors
Secretion:  signal - localization
Homology
Functional
Structure
Biophysics
–
–
–
–
–
–
Composition
Expression
DGE
Change direction refers to the second condition in the label, e.g., positive log2FC for X vs Y → Y up-regulated.
CURRENT STATS:
subset: 18,135 proteins
SCN effectors: 1,221 (putative)
secreted: 2,729    (mean SignalP6: 0.16)
protein length: 422.8 (mean), 7 (min), 5,730 (max)
Core Genomics Effectors Secretion Homology Functional Sequence Structure Biophysics Composition Expression DGE
TF GO terms DeepGoPlus InterPro SMART Pfam FunFam Panther
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0008150 | GO:0032991 | GO:0009987 | GO:0005634 | GO:0140513 | GO:0003674 | GO:1990904 | GO:0008152 | GO:0009058 | GO:0030532 | GO:0120114 | GO:0043170 | GO:0005681 | GO:0005686 | GO:0097525 | GO:0044238 | GO:0044237 | GO:0044249 | GO:0009059 | GO:0010467 | GO:0005488 | GO:0006139 | GO:0034654 | GO:0090304
IPR006568 | IPR052584
SM00581
PF04046
PTHR12785
GO:0005515
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0016020 | GO:0005622 | GO:0043226 | GO:0005737 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0005739
IPR011990
GO:0005515 | GO:0006355 | GO:0070176
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0005737 | GO:0008150 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0009987 | GO:0003674
IPR006222 | IPR013977 | IPR018737 | IPR027266 | IPR028896 | IPR029043
PF01571 | PF08669 | PF10044
G3DSA:3.30.70.1400:FF:000001
PTHR43757
GO:0042302
IPR002486 | IPR008160 | IPR050632
SM01088
PF01391 | PF01484
PTHR24637
GO:0005515
IPR011990 | IPR019734 | IPR052630
PTHR16091
GO:0008150 | GO:0003674 | GO:0005488 | GO:0009987 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0016020 | GO:0008152 | GO:0043170 | GO:0065007 | GO:0009058 | GO:0009059 | GO:0010467 | GO:0044237 | GO:0044249 | GO:0006139 | GO:0044238 | GO:0050789 | GO:0090304
IPR009071 | IPR036910
SM00398
PF00505
PTHR46232
GO:0006629
GO:0003674 | GO:0005575 | GO:0003824 | GO:0110165 | GO:0016787 | GO:0008150 | GO:0016788 | GO:0052689 | GO:0016020 | GO:0005622 | GO:0005737 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0009987 | GO:0043227
IPR002921 | IPR029058
PF01764
PTHR45908
GO:0000981 | GO:0006357 | GO:0046983
GO:0008150 | GO:0065007 | GO:0009987 | GO:0050789 | GO:0050794 | GO:0003674 | GO:0005488 | GO:0005575 | GO:0032501 | GO:0048518 | GO:0110165 | GO:0048522 | GO:0008152 | GO:0009058 | GO:0009059 | GO:0043170 | GO:0044237 | GO:0044249 | GO:0010467 | GO:0019222 | GO:0044238 | GO:0080090 | GO:0060255 | GO:0031323 | GO:0006139 | GO:0034654 | GO:0009889 | GO:0010556 | GO:0031326 | GO:0016070 | GO:0032774 | GO:0090304 | GO:0141187 | GO:0010468 | GO:0009893 | GO:0010604 | GO:0009891 | GO:0019219 | GO:0031325 | GO:0051252 | GO:0006351 | GO:0032502 | GO:0006355 | GO:0031328 | GO:0048856 | GO:2001141 | GO:0005622 | GO:0010557 | GO:0007275 | GO:0045935 | GO:0051254 | GO:0045893 | GO:1902680 | GO:0043226 | GO:0097159 | GO:0043229 | GO:0003676 | GO:0003677
IPR011598 | IPR036638 | IPR040238
SM00353
PF00010
PTHR13864
IPR001304 | IPR016186 | IPR016187 | IPR050976
SM00034
PF00059
PTHR22991
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0005737 | GO:0008152 | GO:0050896 | GO:0016020 | GO:0044237 | GO:0009058 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0065007 | GO:0051716 | GO:0050789 | GO:0044281 | GO:0050794
IPR002818 | IPR029062 | IPR050325
PF01965
PTHR48094
GO:0016787
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0003674 | GO:0005622 | GO:0065007 | GO:0050789 | GO:0050794 | GO:0003824 | GO:0005737 | GO:0140096 | GO:0016787 | GO:0016788 | GO:0050896 | GO:0016020 | GO:0042578 | GO:0016791 | GO:0004721 | GO:0008152
IPR004843 | IPR006186 | IPR029052 | IPR031675 | IPR050341
SM00156
PF00149 | PF16891
G3DSA:3.60.21.10:FF:000007
PTHR11668
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0065007 | GO:0050789 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0051179 | GO:0051234 | GO:0006810 | GO:0005622 | GO:0050896 | GO:0055085 | GO:0051716 | GO:0050794 | GO:0016020 | GO:0032501 | GO:0007154 | GO:0005886 | GO:0071944 | GO:0023052 | GO:0006811 | GO:0034220 | GO:0007165 | GO:0065008 | GO:0003008
IPR019395
PF10268
PTHR13624
IPR038584
GO:0003924 | GO:0005525
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0016020 | GO:0005622 | GO:0071944 | GO:0005886 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0005737 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0008150 | GO:0005773
IPR006689 | IPR019009 | IPR024156 | IPR027417
PF09439
PTHR11711
GO:0015267 | GO:0016020 | GO:0055085
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0008150 | GO:0016020 | GO:0009987 | GO:0005622 | GO:0043226 | GO:0071944 | GO:0043229 | GO:0005737 | GO:0005886 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0003674 | GO:0051179 | GO:0051234 | GO:0006810
IPR000425 | IPR022357 | IPR023271 | IPR034294
PF00230
PTHR19139
GO:0003682
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0008150 | GO:0005622 | GO:0009987 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0003674 | GO:0043231 | GO:0005488 | GO:0005634 | GO:0016043 | GO:0071840 | GO:0065007 | GO:0050789 | GO:0050794 | GO:0005515 | GO:0005737
IPR000949 | IPR001005 | IPR001025 | IPR009057 | IPR017884 | IPR035170 | IPR040138 | IPR043151
SM00439 | SM00717 | SM01189
PF00249 | PF01426 | PF01448 | PF17226
G3DSA:1.10.10.60:FF:000012 | G3DSA:4.10.1240.50:FF:000001
PTHR10865
GO:0003735 | GO:0005840 | GO:0006412
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0016020 | GO:0005622 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0005737 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0005739
IPR000754 | IPR014721 | IPR020568
PF00380
PTHR21569
GO:0005515 | GO:0005634 | GO:0006325 | GO:0006351
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0016020 | GO:0005622 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0016043 | GO:0071840 | GO:0003674 | GO:0006325
IPR001680 | IPR015943 | IPR031120 | IPR036322
SM00320
PF00400
PTHR13831
GO:0005737 | GO:0006508 | GO:0019538 | GO:0030145 | GO:0046872 | GO:0070006
GO:0003674 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0008150 | GO:0005622
IPR000819 | IPR011356 | IPR041417
PF00883 | PF18295
PTHR11963
GO:0004252 | GO:0006508 | GO:0008236
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0003674 | GO:0008152 | GO:0065007 | GO:0016020 | GO:0044238 | GO:0003824 | GO:0043170 | GO:0044237 | GO:0009058 | GO:0044249 | GO:0019538 | GO:0016787 | GO:0005622 | GO:0009059 | GO:0010467 | GO:0071944 | GO:0140096 | GO:0006508 | GO:0008233 | GO:0005886 | GO:0051604 | GO:0016485
IPR000209 | IPR002884 | IPR008979 | IPR015500 | IPR022398 | IPR023827 | IPR023828 | IPR032815 | IPR034182 | IPR036852 | IPR038466
PF00082 | PF01483 | PF16470
G3DSA:2.60.120.260:FF:000020 | G3DSA:3.40.50.200:FF:000004
PTHR42884
PTHR37433
PTHR13401
GO:0003743 | GO:0005515 | GO:0006413
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0005622 | GO:0005737 | GO:0008152
IPR002735 | IPR003307 | IPR016024 | IPR016189 | IPR016190 | IPR045196
SM00515 | SM00653
PF01873 | PF02020
G3DSA:1.25.40.180:FF:000091 | G3DSA:2.20.25.350:FF:000001 | G3DSA:3.30.30.170:FF:000002
PTHR23001
GO:0003743 | GO:0005515 | GO:0006413
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0005622 | GO:0008152 | GO:0044238 | GO:0005737
IPR002735 | IPR003307 | IPR016024 | IPR016189 | IPR016190 | IPR045196
SM00515 | SM00653
PF01873 | PF02020
G3DSA:1.25.40.180:FF:000091 | G3DSA:2.20.25.350:FF:000001 | G3DSA:3.30.30.170:FF:000002
PTHR23001
GO:0016624 | GO:0030976
GO:0008150 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0009987 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0003674 | GO:0005737
IPR001017 | IPR005475 | IPR011603 | IPR029061 | IPR031717 | IPR042179
SM00861
PF00676 | PF02779 | PF16870
PTHR23152
GO:0000159 | GO:0007165 | GO:0019888
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0005737 | GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0043226 | GO:0003674 | GO:0043229 | GO:0016020 | GO:0005488
IPR002554 | IPR011989 | IPR016024
PF01603
G3DSA:1.25.10.10:FF:000353
PTHR10257
GO:0017196 | GO:0031417
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0005737 | GO:0065007
IPR007244
PF04112
PTHR21373
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0008150 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0009987 | GO:0043227 | GO:0043229 | GO:0071840 | GO:0065007 | GO:0043231 | GO:0016043 | GO:0050789 | GO:0050794 | GO:0005737 | GO:0032991 | GO:0005634
IPR007858 | IPR049629
PF05186
G3DSA:1.20.890.10:FF:000003
Yes
GO:0001228 | GO:0006355 | GO:0016602 | GO:0046982
GO:0008150 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0009987 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0065007 | GO:0050789 | GO:0016020 | GO:0050794 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0008152 | GO:0044237
IPR003958 | IPR009072 | IPR027113
PF00808
G3DSA:1.10.20.10:FF:000099
PTHR11064
IPR002575 | IPR011009 | IPR050249
PF01636
PTHR21064
GO:0016192 | GO:0035658
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0016020 | GO:0005622 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0005737 | GO:0071944 | GO:0005886
IPR013176 | IPR043987 | IPR043988
PF19031 | PF19032
PTHR13056
GO:0003676
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043228 | GO:0043232
IPR000467 | IPR025239 | IPR039249
SM00443 | SM01173
PF01585 | PF13821
PTHR21032
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0005634 | GO:0032991 | GO:0140513 | GO:1990904 | GO:0005681 | GO:0005682 | GO:0030532 | GO:0071014 | GO:0097525 | GO:0120114
IPR006767 | IPR006768 | IPR036265 | IPR040194
PF04676 | PF04677
PTHR12072
GO:0005975 | GO:0016301
GO:0003674 | GO:0008150 | GO:0003824 | GO:0009987 | GO:0016740 | GO:0016772 | GO:0016301 | GO:0016773 | GO:0046316 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0008152 | GO:0044238 | GO:0044237 | GO:0005622 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0016020 | GO:0005737 | GO:0009056 | GO:0044281 | GO:0044248 | GO:0043227 | GO:0006082 | GO:0019752 | GO:0043436 | GO:0005975 | GO:0016054 | GO:0032787 | GO:0044282 | GO:0046395 | GO:0072329 | GO:0016052 | GO:0019520 | GO:0019521 | GO:0046176 | GO:0046177 | GO:0043231
IPR006001 | IPR027417 | IPR031322
PF01202
PTHR43442
GO:0016020 | GO:0051119
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0003674 | GO:0006810 | GO:0051179 | GO:0051234 | GO:0055085 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005215 | GO:0022857 | GO:0008643 | GO:0034219 | GO:0016020 | GO:0015144
IPR004316 | IPR047664
PF03083
PTHR10791
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0071840 | GO:0016043 | GO:0005575 | GO:0006996 | GO:0110165 | GO:0007049 | GO:0022402 | GO:0051276 | GO:0007062 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0008152 | GO:0044238 | GO:0043170
IPR016181 | IPR028005 | IPR028009
PF13878 | PF13880
PTHR45884
GO:0000938 | GO:0042147
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0071944 | GO:0005737 | GO:0005886 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0008150 | GO:0005773 | GO:0012505 | GO:0009987 | GO:0005794 | GO:0032991
IPR012501 | IPR019515 | IPR039745
PF07928 | PF10475
PTHR12965
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0008150 | GO:0005634 | GO:0043228 | GO:0043232
IPR005612 | IPR011501 | IPR016903
PF03914 | PF07540
PTHR14428
GO:0008150 | GO:0003674 | GO:0008152 | GO:0003824 | GO:0016787 | GO:1901135 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0016798 | GO:0016799 | GO:0005622 | GO:0009987 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043227
IPR012816 | IPR037238
PF08719
GO:0047134
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0003674 | GO:0005622
IPR007588 | IPR010357 | IPR036249 | IPR045108
PF04500 | PF06110
PTHR12452
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0008150 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0065007 | GO:0032502 | GO:0009987 | GO:0050789 | GO:0050794 | GO:0005634 | GO:0008152 | GO:0043170 | GO:0048856 | GO:0009058 | GO:0044237 | GO:0044238 | GO:0009059 | GO:0044249 | GO:0010467 | GO:0019222 | GO:0031323 | GO:0060255 | GO:0080090 | GO:0006139 | GO:0034654 | GO:0009889 | GO:0090304 | GO:0031326 | GO:0003674 | GO:0010468 | GO:0010556 | GO:0016070 | GO:0141187 | GO:0032774
IPR040436
PTHR15021
GO:0008150 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0016020 | GO:0005622 | GO:0043226 | GO:0032502 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0065007 | GO:0050789 | GO:0009987 | GO:0050794 | GO:0043231 | GO:0048856 | GO:0008152 | GO:0019222 | GO:0005634 | GO:0031323 | GO:0044237 | GO:0044238 | GO:0080090 | GO:0043170 | GO:0060255 | GO:0009058 | GO:0009059 | GO:0009889 | GO:0010467 | GO:0010556 | GO:0031326 | GO:0044249 | GO:0010468 | GO:0006139 | GO:0016070 | GO:0090304 | GO:0032774 | GO:0034654 | GO:0141187 | GO:0019219 | GO:0051252 | GO:0006351 | GO:0006355 | GO:2001141 | GO:0003674 | GO:0005488
IPR013087 | IPR040436
SM00355
PTHR15021