Filters

–
Putative Effectors
Secretion:  signal - localization
Homology
Functional
Structure
Biophysics
–
–
–
–
–
–
Composition
Expression
DGE
Change direction refers to the second condition in the label, e.g., positive log2FC for X vs Y → Y up-regulated.
CURRENT STATS:
subset: 18,135 proteins
SCN effectors: 1,221 (putative)
secreted: 2,729    (mean SignalP6: 0.16)
protein length: 422.8 (mean), 7 (min), 5,730 (max)
Core Genomics Effectors Secretion Homology Functional Sequence Structure Biophysics Composition Expression DGE
TF GO terms DeepGoPlus InterPro SMART Pfam FunFam Panther
GO:0005975 | GO:0016757
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0008152 | GO:0003674 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0044237 | GO:0009058 | GO:0044238 | GO:0044249 | GO:0003824 | GO:1901135 | GO:0016020 | GO:0005622 | GO:1901137 | GO:0016740
IPR003859 | IPR027791 | IPR027995 | IPR029044
PF02709 | PF13733
PTHR19300
GO:0004930 | GO:0007186 | GO:0016020
IPR000276 | IPR017452 | IPR019424 | IPR047130
SM01381
PF10320
PTHR23360
IPR009057
GO:0003677
IPR003656 | IPR036236
SM00614
PF02892
IPR009057
GO:0005515
GO:0008150 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0005737
IPR001870 | IPR003877 | IPR013320 | IPR043136 | IPR044736 | IPR050618
SM00449
PF00622
PTHR12864
IPR019425
PF10321
PTHR23021
IPR023211 | IPR043502
PTHR33568
GO:0022857 | GO:0055085
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0003674 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0051179 | GO:0006810 | GO:0051234 | GO:0055085 | GO:0016020 | GO:0005215 | GO:0022857 | GO:0071944 | GO:0005886
IPR011701 | IPR020846 | IPR036259
PF07690
PTHR45757
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0005737 | GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0016020 | GO:0065007
IPR001303 | IPR036409
SM01007
PF00596
PTHR10640
GO:0008150 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0009987 | GO:0051179 | GO:0006810 | GO:0051234 | GO:0033036 | GO:0010876 | GO:0006869 | GO:0015850 | GO:0015918 | GO:0003674 | GO:0005622
IPR003172 | IPR014756
SM00737
PF02221
G3DSA:2.60.40.770:FF:000001
GO:0016491
GO:0003674 | GO:0008150 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005488 | GO:0008152 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0003824 | GO:0043226 | GO:0009987
IPR002227 | IPR003582 | IPR008922 | IPR050316
SM00254
PF00264 | PF01549
PTHR11474
GO:0003824 | GO:0016491 | GO:0019594
GO:0003674 | GO:0003824 | GO:0016491 | GO:0008150 | GO:0016614 | GO:0016616
IPR000669 | IPR008927 | IPR013118 | IPR013131 | IPR013328 | IPR023027 | IPR036291 | IPR050988
PF01232 | PF08125
PTHR43362
GO:0000139 | GO:0015165 | GO:0016020 | GO:0090481
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0016020 | GO:0071944 | GO:0008150 | GO:0005886 | GO:0009987 | GO:0005622 | GO:0006810 | GO:0051179 | GO:0051234 | GO:0043226 | GO:0005737 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0055085 | GO:0043231 | GO:0003674 | GO:0005773 | GO:0012505 | GO:0071705 | GO:0015711 | GO:1901264 | GO:0005215 | GO:0022857
IPR007271
PF04142
PTHR10231
GO:1990817
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0043226 | GO:0016020 | GO:0043229 | GO:0043227 | GO:0008150 | GO:0003674 | GO:0043231
IPR007012
PF04928
PTHR10682
GO:0005515
IPR000210 | IPR011333
SM00225
PF00651
PTHR22744
GO:0016407 | GO:0016740
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0003674 | GO:0003824 | GO:0005622 | GO:0005737
IPR001451 | IPR011004 | IPR018357 | IPR024688 | IPR051159
SM01266
PF00132 | PF12464
G3DSA:2.160.10.10:FF:000025
PTHR23416
GO:0004363 | GO:0005524 | GO:0006750 | GO:0016874
GO:0008150 | GO:0003674 | GO:0008152 | GO:0009987 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0050896 | GO:0044237 | GO:0009058 | GO:0003824 | GO:0044249 | GO:0006790 | GO:0005622 | GO:0006518 | GO:0006575 | GO:0006749 | GO:0006750 | GO:0019184 | GO:0042398 | GO:0043043 | GO:0043603 | GO:0043604 | GO:0044272 | GO:0016874 | GO:0004363 | GO:0016879 | GO:0016881 | GO:1904091
IPR004887 | IPR005615 | IPR014042 | IPR014049 | IPR016185 | IPR037013
PF03199 | PF03917
PTHR11130
GO:0004363 | GO:0005524 | GO:0006750 | GO:0016874
GO:0008150 | GO:0003674 | GO:0008152 | GO:0009987 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0050896 | GO:0044237 | GO:0009058 | GO:0003824 | GO:0044249 | GO:0005622 | GO:0006790 | GO:0006518 | GO:0006575 | GO:0006749 | GO:0006750 | GO:0019184 | GO:0042398 | GO:0043043 | GO:0043603 | GO:0043604 | GO:0044272 | GO:0016874 | GO:0004363 | GO:0016879 | GO:0016881 | GO:1904091 | GO:0005737
IPR004887 | IPR005615 | IPR014042 | IPR014049 | IPR014709 | IPR016185 | IPR037013
PF03199 | PF03917
PTHR11130
Yes
GO:0008150 | GO:0032502 | GO:0048856 | GO:0032501 | GO:0009987 | GO:0007275 | GO:0005575 | GO:0003674 | GO:0005488 | GO:0065007 | GO:0050789 | GO:0050794 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0003676 | GO:0097159 | GO:0048731 | GO:0043226 | GO:0043229
IPR009071 | IPR036910 | IPR050140
SM00398
PF00505
G3DSA:1.10.30.10:FF:000002
PTHR10270
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0008150 | GO:0005622 | GO:0065007 | GO:0050789 | GO:0009987 | GO:0050794 | GO:0016020 | GO:0003674 | GO:0048518 | GO:0043226 | GO:0043229 | GO:0005737 | GO:0050896 | GO:0048522 | GO:0043227
IPR001841 | IPR013083
SM00184
PF13920
PTHR46858
GO:0003674 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0003824 | GO:0140096 | GO:0008150 | GO:0016740
IPR001841 | IPR013083
PF13920
PTHR46858
IPR003582
SM00254
PF01549
G3DSA:1.10.10.1940:FF:000002
PTHR46219
GO:0016491
GO:0003674 | GO:0008150 | GO:0005488 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0008152 | GO:0009987 | GO:0016020 | GO:0009058 | GO:0005622 | GO:0003824 | GO:0043226 | GO:0005737 | GO:0005515 | GO:0043227 | GO:0043229 | GO:1901615 | GO:1901617 | GO:0019748 | GO:0044550 | GO:0043231
IPR002227 | IPR003582 | IPR008922 | IPR050316
SM00254
PF00264 | PF01549
PTHR11474
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0005737 | GO:0008150 | GO:0016020 | GO:0009987 | GO:0065007 | GO:0050789 | GO:0043226 | GO:0050794 | GO:0043229
IPR019311 | IPR043472
PF10154
PTHR16525
Yes
GO:0003700 | GO:0005634 | GO:0006355
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0065007 | GO:0050789 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0050794 | GO:0003674 | GO:0005622 | GO:0048518 | GO:0008152 | GO:0043170 | GO:0048522 | GO:0019222 | GO:0031323 | GO:0044237 | GO:0005488 | GO:0060255 | GO:0044238 | GO:0080090 | GO:0009058 | GO:0009059 | GO:0044249 | GO:0009889 | GO:0010467 | GO:0010468 | GO:0010556 | GO:0031326 | GO:0032501 | GO:0009893 | GO:0043226 | GO:0006139 | GO:0034654 | GO:0010604 | GO:0031325 | GO:0032502 | GO:0090304 | GO:0009891 | GO:0016070 | GO:0032774 | GO:0141187 | GO:0019219 | GO:0031328 | GO:0051252 | GO:0006351 | GO:0043229 | GO:0010557 | GO:0006355 | GO:2001141 | GO:0045935 | GO:0016020 | GO:0051254 | GO:0006357 | GO:0006366 | GO:0045893 | GO:1902680 | GO:0048856 | GO:0045944 | GO:0007275 | GO:0097159 | GO:0048731 | GO:0003676
IPR004979 | IPR013854
PF03299
PTHR10812
GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0003674 | GO:0043229 | GO:0005737 | GO:0043227 | GO:0043231 | GO:0003824 | GO:0016787 | GO:0016788 | GO:0016791 | GO:0042578 | GO:0005634
IPR013078 | IPR029033 | IPR051710
SM00855
PF00300
PTHR16469
GO:0046983
GO:0008150 | GO:0009987 | GO:0065007 | GO:0050789 | GO:0050794 | GO:0032501 | GO:0032502 | GO:0048856 | GO:0007275 | GO:0048731 | GO:0005575 | GO:0110165 | GO:0003674 | GO:0005488 | GO:0007399 | GO:0005622 | GO:0016020 | GO:0043226 | GO:0043229
IPR011598 | IPR036638 | IPR050359
SM00353
PF00010
PTHR19290